El Colegio Cooperativo San Francisco de Asís bajo el lema “EDUCAR PARA LA EXCELENCIA CON AUTONOMÍA Y VALORES”; pretende motivar y orientar a los jóvenes a la búsqueda continua de un mejoramiento humano e intelectual guiándose y respetando las normas de convivencia humana. El Colegio Cooperativo San Francisco de Asís se basa en principios de convivencia pacífica, en el respeto a los derechos humanos, a la Constitución Política de Colombia, a las normas establecidas en el Código de infancia y adolescencia, la Ley General de Educación y su Decreto Reglamentario 1860 de 1994. El Decreto 1290 y las demás normas reglamentarias procurando con esto brindar una excelente formación integral en los integrantes de la Comunidad Educativa. El fundamento filosófico de la institución ha estado representado por sus símbolos: la bandera, el escudo y su himno, donde se pone en evidencia el orgullo al Santo Patrón, las riquezas naturales y espirituales, la fe, la esperanza en el futuro y la capacidad de trabajo de las gentes que han hecho de la institución el motivo que impulsa a los estudiantes a crecer en la sabiduría dentro de los valores más reconocidos en la convivencia humana.
Las metas y los objetivos a mediano y largo plazo tendrán como principio fundamental, el tener en cuenta las potencialidades y perspectivas del entorno en que vive el colegio a través de un currículum lógico y razonable sin perder de vista la función educativa prevista por las normas establecidas por el Estado.
Con los acelerados cambios que suceden en el mundo, el Colegio Cooperativo “San Francisco de Asís” deberá actualizar periódicamente sus herramientas técnicas, didácticas y pedagógicas que permitan a sus estudiantes vivenciar esa realidad evolutiva, para que se le facilite obtener resultados concretos frente a su esfuerzo intelectual y económico, dándole así los medios necesarios para su realización como persona útil dentro del contexto social, cultural y laboral.